Исследователи Стэнфордского университета использовали генеративный искусственный интеллект для создания с нуля жизнеспособных бактериофагов — вирусов, поражающих бактерии. Работа демонстрирует принципиальную возможность конструирования новых биологических объектов, однако авторы и независимые специалисты подчеркивают, что результаты получены в лабораторных условиях и до применения в клинической практике дистанция значительная.
Как устроено исследование
В основе эксперимента лежит бактериофаг phiX174, инфицирующий кишечную палочку Escherichia coli. Это классический модельный объект молекулярной биологии, хорошо изученный и безопасный для лабораторной работы. Исследователи обучили две генеративные модели — EVo1 и Evo2 — на миллионах микробных геномов. Алгоритмы работают по принципу, сходному с языковыми моделями: вместо последовательностей слов они предсказывают последовательности нуклеотидов.
Из тысяч сгенерированных вариантов ученые отобрали 300 наиболее перспективных, химически синтезировали их и протестировали в лабораторных условиях. Результат: 16 сконструированных фагов оказались жизнеспособными. Они обладали генетическими последовательностями и структурами, отличными как друг от друга, так и от любых известных природных фагов. Несколько синтетических вариантов смогли инфицировать штаммы бактерий, устойчивые к природному phiX174.
Подробнее https://www.pravda.ru/news/health/...